胎儿磁共振主要是检查结构上有没有异常，比如你的脑室有没有增宽心脏有没有畸形脊柱排列是否正常，而羊水穿刺主要是来提取胎儿的DNA来检测胎儿的染色体有没有异常？所以他们两个检查项目是完全不一样的。
羊水穿刺，一般是在24周之前进行，一般对于高龄产妇，或者是既往存在不良孕产史的产妇或者是之前的唐氏筛查做出来有问题的产妇才会选择羊水穿刺，而胎儿磁共振是对于我们B超提示存在结构异常的患者，我们可能会建议他进一步进行胎儿磁共振检查。
胎儿磁共振和羊水穿刺的区别
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健康
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