卡氏肺囊虫肺炎主要表现为低热、干咳少痰、呼吸困难，活动以后加重，体检可以有轻度的紫绀，两肺偶有痰鸣音，血气氧分压下降明显，胸片可见肺纹理增多或斑片状阴影，严重的时候两肺有大片融合状阴影。
若作纤维支气管镜灌洗液检查，可以找到卡氏肺囊虫滋养体和包囊，肺结核也是艾滋病，常见的机会感染性疾病之一。艾滋病患者的肺结核进展很快，可见结核性的空洞和痰菌阳性，治疗也比较困难。也可以表现全身播散性的结核，艾滋病的机会感染性疾病，还常见的有弓形体病、鸟型分支杆菌感染以及真菌感染和病毒感染。
弓形体病的患者常表现有头痛、发热、脑膜炎、视网膜脉络炎等，外周血中可以检测抗弓形体抗体。艾滋病患者常见口腔念珠菌感染，也有食道或结肠的念珠菌感染，隐球菌脑膜炎以及组织胞浆菌或青霉菌的全身感染等，艾滋病患者常见有各种病毒感染，例如乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、水痘带状疱疹病毒、巨细胞病毒和EB病毒感染等。
艾滋病是由人免疫缺陷病毒感染，T辅助淋巴细胞而引起的获得性免疫缺陷综合征，属于性传播性疾病之一。
艾滋病最常见的机会性感染是结核，艾滋病由于HIV病毒攻击人体免疫系统，使人体免疫功能丧失，对各种感染的防御能力下降，最容易感染结核分枝杆菌。
除结核之外，还容易出现反复发作的口腔白色念珠菌感染，以及反复发作的单纯疱疹病毒感染、带状疱疹病毒感染、卡氏肺孢子虫肺炎，反复发生细菌性肺炎、深部真菌感染、中枢神经系统占位性病变，中、青年人出现痴呆和活动性巨细胞病毒感染、弓形虫脑病，反复发生败血症。艾滋病晚期除了对感染的防御能力下降，对恶性肿瘤的防御能力也会下降，所以容易出现恶性肿瘤，包括卡波西肉瘤、淋巴瘤等。