巧克力囊肿可影响怀孕。
巧克力囊肿又称子宫内膜异位囊肿，巧克力囊肿患者的不孕率高达40%。巧克力囊肿患者会因为卵巢、输卵管粘连而影响受精卵的正常运输，从而影响女性的正常受孕。如果出现巧克力囊肿破裂，则会导致整个盆腔组织粘连的情况发生，影响受孕。对于有生育要求的女性一般采取药物或手术治疗，并根据自身情况定期随访检查。
患有卵巢巧克力囊肿，不要有过多的心理负担，应该积极配合医生治疗。巧克力囊肿是否可以怀孕，由患者的具体情况而定。在怀孕初期出现卵巢巧克力囊肿，需要分清楚它到底是生理性的还是病理性的。如果是生理性的卵巢囊肿，随着孕期的慢慢增长，大约是三四个月后，囊肿就会慢慢消失；因此对于异位程度较轻、病程较短的巧克力囊肿，在保守治疗的情况下是可以怀孕的；而病灶多、病情严重，甚至造成盆腔粘连或输卵管受损的巧克力囊肿，往往是很难怀孕的。其中，卵巢巧克力囊肿是指异位种植在卵巢上的子宫内膜，随月经周期剥脱后却无法排出，在卵巢上形成了陈旧的血性囊肿。
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