艾滋病检查一般可挂感染科或皮肤性病科。
综合医院中，感染科是专门诊治各类感染性疾病的科室，艾滋病属于由病毒引起的感染性疾病，挂感染科可以得到专业的艾滋病相关检查及诊疗服务。
部分专科医院设有皮肤性病科，艾滋病可通过性传播等途径感染，属于皮肤性病范畴，所以也可挂皮肤性病科进行艾滋病检查。
对于成年人来说，可根据所在医院的科室设置选择相应科室；对于儿童，同样可选择感染科或设有儿童感染相关专科的科室进行艾滋病检查，儿童由于其生理特点，检查时需特别注意操作的温和与合适。
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