一、对亚麻籽油过敏者
人体免疫系统对亚麻籽油中的某些成分识别为外来异物，引发免疫反应，此类人群摄入后可能出现皮肤瘙痒、红斑、皮疹，严重时可导致呼吸困难、喉头水肿等过敏症状，危及生命，因此对亚麻籽油过敏者严禁食用。
二、患有出血性疾病者
亚麻籽油具有一定的抗凝血作用，会影响血液的凝固功能。患有如血友病、血小板减少性紫癜等出血性疾病的人群，食用后可能加重体内出血倾向，不利于病情控制，故此类人群应避免食用亚麻籽油。
三、甲状腺功能减退患者
亚麻籽油中的某些成分可能干扰甲状腺素的代谢过程，而甲状腺功能减退患者本身存在甲状腺素分泌不足的情况，食用亚麻籽油可能进一步影响甲状腺功能的调节，加重病情，所以甲状腺功能减退患者需谨慎食用亚麻籽油。
四、婴儿群体
婴儿消化系统尚未发育成熟，对脂肪的消化吸收能力有限。亚麻籽油中的长链脂肪酸等成分难以被婴儿稚嫩的胃肠道充分消化，易引起腹泻、呕吐等胃肠道不适症状，因此婴儿不宜直接食用亚麻籽油，如需添加相关油脂应选择更适合婴儿消化的专用油脂。