每天凌晨3～5点均胃痛，考虑为节律性上腹痛，多是消化性溃疡的表现，由于凌晨3～5点多为空腹，因此主要考虑十二指肠溃疡。另外，胰腺或胆囊出现病变也会导致以上这种情况。建议尽早就医，在专业医师指导下明确病因。
1.消化性溃疡：最突出的症状是上腹部慢性、节律性、周期性疼痛。如果每天凌晨3～5点都出现胃部疼痛，极有可能是消化性溃疡的表现。消化性溃疡要包括胃溃疡和十二指肠溃疡，胃溃疡主要为餐后疼痛，十二指肠溃疡为空腹痛，因此主要考虑十二指肠溃疡。
2.胰腺或胆囊病变：如果胰腺或胆囊出现病变，也可表现为凌晨空腹状态下胃脘、腹部的疼痛不适感。
肠道菌群是指定植在人体肠道内并长期与人体相互依存的细菌群，包括40多个菌属，400到500种菌种，数量达100万亿之多，是人体细胞的10倍，重量上相当于一个人的肝脏，占健康成人每日排出粪便的1/3到2/5。
肠道菌群是指定植在人体肠道内并长期与人体相互依存的细菌群，包括40多个菌属，400到500种菌种，数量达100万亿之多，是人体细胞的10倍，重量上相当于一个人的肝脏，占健康成人每日排出粪便的1/3到2/5。
依据肠道菌群在肠道内的分布层次和存在情况，可以将其分为膜菌群和腔菌群两大类：膜菌群又称为原籍菌，在出生后数天就能贴近黏膜表面定植，是长期居住的细菌，成年时仍保持较多数量，与定植部位的上皮有密切联系，如双歧杆菌、厌氧乳杆菌、拟杆菌等；腔菌群又称外籍菌，主要存在于肠腔内，是数量少、不稳定的过路菌，如铜绿假单胞菌、肠球菌、大肠杆菌等。一旦腔菌群的数量增多，就会引发疾病。
依据肠道菌群与人体的关系，我们人为地把它们分为敌我友三大类：
1、是我们的朋友即有益菌如双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等；
2、是我们的敌人即有害菌如葡萄球菌、绿脓杆菌等；
3、是中间分子即中间菌如肠球菌、大肠杆菌等。不同人的肠道菌群，其组成和数量存在个体差异，可能受个体的遗传性控制。
肠道的菌群有很多，主要可以分为主要菌群和次要菌群。主要菌群通常指的是肠道菌群中数量大或者种群密集度大的细菌，多数在10笃10cfu/g以上，主要包括类杆菌属、优杆菌属、瘤胃球菌属以及梭菌属等专性厌氧菌，多数属于原籍菌群。次要菌群，通常数量在10至10cfu/g以下，主要是需氧菌或者兼性厌氧菌，比如大肠杆菌和链球菌等，流动性比较大，通常有潜在致病性，大部分属于外籍菌群或过路菌群。