长期腹泻的原因包括慢性感染性疾病、非感染性疾病、胃动力方面的疾病、肿瘤性疾病和肝胆胰腺的疾病等。
（1）慢性感染性疾病：会引起长期腹泻的慢性感染性疾病常见的有：慢性阿米巴痢疾、慢性细菌性疾病和肠道念珠菌感染性疾病等。
（2）非感染性疾病：有些非感染性疾病，也会导致患者长期腹泻。比如：结肠克罗恩病、放射性结肠炎、溃疡性结肠炎、缺血性结肠炎、尿毒症性结肠炎等等。
（3）胃动力方面疾病：胃动力方面的病主要是肠易激综合征，这种疾病也会引起患者的长期腹泻。
（4）肿瘤性疾病：肠道有肿瘤时也会使得患者长期腹泻。比如：大肠癌、结肠腺瘤、小肠恶性淋巴瘤，以上疾病都有可能引起长期腹泻。
（5）胃和肝胆胰腺疾病：如果患者存在诸如萎缩性胃炎、慢性肝炎、慢性胰腺炎等病症，也能导致患者产生长期腹泻。
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